A FAPAS através do Gabinete de Projetos viabiliza projetos de iniciação científica de acordo com a missão da Instituição, que busca em suas ações, promover e valorizar o ser humano, fortalecendo a cidadania, através da prática da excelência no ensino de graduação, pesquisa e extensão e em sua atuação na sociedade. Todo o Projeto de Iniciação Científica deverá ser coordenado por um professor da FAPAS.

Os projetos são elaborados segundo critérios definidos pela Coordenação de Iniciação Científica e Extensão em Editais e ainda há os projetos inscritos em fluxo contínuo. Os projetos podem ser renovados a cada ano, conforme o tempo previsto para a sua consecução. O Projeto de Iniciação Científica deverá contemplar uma ou mais linhas de Pesquisa da FAPAS ou dos cursos de Direito, Filosofia e Teologia.